Gaskromatografens (GC) isotopforholdsmassespektrometer (IRMS) bruges til at måle forbindelsesspecifikke kulstof- og hydrogenisotoper i biomarkører. GC'en separerer forbindelserne i en blanding, som derefter omdannes til en målbar gas i enten en forbrændingsreaktor (CO2) eller en højtemperaturkonverteringsreaktor (H2). Gasserne introduceres derefter i IRMS'en via en kontinuerlig flowenhed, der håndterer bære- og referencegasser.
ThermoFisher Scientific GC-IRMS består af en programmerbar temperaturfordampningsinjektor (PTV), TRACE GC 1610, GC IsoLink II, ConFlo IV University Interface og DELTA Q IRMS udstyret med standard triple collector (CO2) og HD-kollektor (H2).